Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms