Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HAPLN4Q86UW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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