Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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