Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC141Q6ZP82 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms