Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC36A4Q6YBV0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms