Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TREML4Q6UXN2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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