Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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