Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms