Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED9Q6R2W3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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