Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUT3

MFSD12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12Q6NUT3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MFSD12Q6NUT3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms