Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms