Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP170Q5SW79 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms