Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms