Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms