Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms