Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms