Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC92Q53HC0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms