Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms