Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms