Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GREB1Q4ZG55 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GREB1Q4ZG55 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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