Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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