Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms