Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATP6V1FQ16864 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms