Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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HIST2H2BEQ16778 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIST2H2BEQ16778 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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