Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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