Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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