Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8Q15843 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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