Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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