Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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SYCP1Q15431 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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SYCP1Q15431 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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SYCP1Q15431 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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SYCP1Q15431 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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SYCP1Q15431 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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