Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms