Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms