Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms