Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms