Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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