Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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