Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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IKZF1Q13422 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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IKZF1Q13422 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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