Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF6Q13247 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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