Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms