Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CHAF1BQ13112 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CHAF1BQ13112 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CHAF1BQ13112 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CHAF1BQ13112 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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