Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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