Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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