Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTP4A2Q12974 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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