Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms