Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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