Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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