Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFCP2Q12800 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms