Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1AQ12756 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1AQ12756 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms