Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEXNQ0ZGT2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEXNQ0ZGT2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms