Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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