Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms