Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms